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 Herr Dr. Werner ist Facharzt für Innere Medizin mit den Zusatzweiterbildungen Diabetologie und Genetische Beratung - fachgebunden im Gebiet Innere Medizin. Von der Deutschen Hochdruckliga ist er als Hypertensiologe anerkannt. Seit April 2015 leitet er das Diabeteszentrum Bad Lauterberg.
Seine Facharztausbildung und Weiterbildung zum Diabetologen absolvierte er im Klinikum Weimar unter Leitung von Prof. Dr. H. Schmechel und Prof. Dr. R. Fünfstück. Dort war er von 2008 bis 2015 als Oberarzt (Nephrologie/Diabetologie) tätig. In dieser Funktion baute er maßgeblich ein diabetisches Fußzentrum auf. Außerdem leitete er eine hausärztliche Fußsprechstunde im angeschlossenen MVZ.
Im Diabeteszentrum Bad Lauterberg etablierte er eine von der DDG zertifizierte Fußstation, war Gründungsmitglied im Fußnetzwerk Niedersachsen, strukturierte die Schulung der Klinik um, initiierte die Gründung eines Medizinischen Versorgungszentrums mit diabetologischem Schwerpunkt und baute die Kooperation mit dem regionalem Dialysezentrum Viamedis aus.
Mehrere Jahre arbeitete Dr. Werner als Vorstandsmitglied der Thüringer Gesellschaft für Diabetes und Stoffwechselerkrankungen und im Bundesverband Klinischer Diabetes-Einrichtungen e.V. - Die Diabetes Kliniken (BVKD). Im Jahr 2017, 2019 und im Mai 2021 wurde er zum 1. Vorsitzenden des BVKD gewählt. Dr. Werner ist Mitglied in der Deutschen Diabetes Gesellschaft und der AG Fuß der DDG. Als Referent ist er aktiv in der Fort- und Weiterbildung von Ärzten und Diabetesberaterinnen engagiert. Er besitzt die volle Weiterbildungsermächtigung zur Ausbildung zum Diabetologen. Seit 2020 ist er an der PFH – Privaten Hochschule Göttingen als Dozent tätig.